您好，没有软著证书并不代表权利不受保护。软件开发完成之日即产生著作权，登记证书只是初步证据。
您可以重点从“计算机软件著作权侵权”和“侵犯商业秘密”两个维度出击。首先，立即收集您公司的源代码文件、开发文档、Git提交时间戳记录，申请公证处进行证据保全。其次，对比前员工新公司的软件界面、交互逻辑、数据库结构是否高度相似。如果涉及核心机密，可追究其侵犯商业秘密。
建议您先调取该员工在职时签署的《劳动合同》和《保密协议》看看有没有适用条款，后续不明白再来咨询